Избавиться от софтбедов, переформатировать флешку

1. Забить нулями флешку: dd if=/dev/zero of=/dev/sdb
2. Проверить запись: dd if=/dev/sdb | md5sum после посмотреть сколько записей считалось и запустить: dd if=/dev/zero count=(сколько записей было выше) в результате должны получится одинанвые чексуммы.
3. Создать примари раздел при помощи fdisk, поставить флаг раздера FAT16 или FAT32
4. Создать файловую систему: mkdosfs /dev/sdb или mkfs.vfat /dev/sdb

Всё, после этого должно работать. Если баги были на момент проверки, значит на флешке есть аппаратные косячки.

Вместо FAT можно создать и другие файловые системы, на ваше усмотрение.