WTP - Eclipse Web Tools Platform. Набор расширений для удобной работы с WEB проектами. Деплой на различные серверы приложений, отладка, профилирование и много всего другого вкусного.

Про Maven не пишу, многим понятно. В последних версиях плагина для Eclipse в extra есть модули для j2ee проектов различных версий соглашений (j2ee 5/6 и младше). Но статья по ссылке:

http://www.devx.com/Java/Article/36785

будет полезна как инструкция по переводу существующего проекта, созданного средсвами Eclipse и WTP на сборку maven’ом.