Короткая заметка и ссылки. Возможно потом дополню информацией о разрешении (resolution) временных меток.

• FAT/FAT32
  • Хранит локальное время, без указания Timezone. Поменяешь в системе зону - время создания файлов останется без изменений. Т.е. нужно помнить в какой ТЗ они создавались.
  • Windows сохраняет вот прям вот локальное время
  • Linux добавляет час, при переводе часов
  • timestamp:
    • дата 16 битное число: 7 бит - год, 4 бита - месяца, 5 бит - день. Год в диапазоне 1980-2107.
    • время 16 битное число для часов, минут, секунд
• exFAT:
  • Время хранится локальное. Но есть нюанс.
  • Временная зона хранится в 1 байте. Vista SP1 не использует его. Что бы нормально жилось, старший бит сигнализирует - применять или нет смещение зоны. 0 - не применять. 1 - применять. Остальные 7 бит - 15минутные интервалы для смещения. Положительное направление - на восток.
  • Т.е. если бит 7 в TZ поднят, то система будет пересчитывать время файла в UTC, что бы корректно отобразить в системе при смене часового пояса. Эдакая обратная совместимость.
• NTFS
  • Время хранится в UTC
• EXTx (EXT2/3/4)
  • Время хранится в UTC

Полезные ссылки

• Windows and Unix/Linux handle the effect of DST (daylight saving time) on time stamps differently
  • NTFS
  • FAT/FAT32
  • EXT2
• Does the filesystem windows is installed on have an effect on the time zone settings of timestamps within windows registry hives?
  • FAT64/exFAT
• exFAT File System Time Zone Concerns - смотреть через Tor
  • exFAT
• exFAT Filesystem
  • Похоже, что таки время локальное. Но TZ offset хранит зону, и можно посчитать UTC
  • CreateTZOffset
• Исходники Linux 5.7+ - есть нативная реализация exFAT.